El de La Campiña es el 8º entrenador con más partidos en 1ª División con 459, en activo sólo le superan Javier Clemente, Víctor Fernández y Javier Irureta, aunque ninguno de ellos entrena actualmente en España por lo que no pueden aumentar la cifra, mientras tanto el utrerano ha entrenado 152 partidos al Sevilla; 76 al Deportivo de La Coruña; 152 al Athletic Club; 54 al Mallorca y en la actualidad lleva 25 encuentros con el Levante U.D. en la máxima categoría. Lejos quedan los 757 de Luis Aragonés, pero el técnico de 58 años puede seguir aumentando dicha cifra.
El gran paso adelante en los banquillos de Jokin fue con el Recreativo de Huelva, equipo con el que logró el ascenso a 2ª División en la temporada 97-98, tras quedar 2º en el campeonato regular tras el Málaga, y vencer en la liguilla de playoff al Barakaldo, Espanyol B y Deportivo B, al sumar 15 de 18 puntos posibles, el ascenso se consumó a falta de dos jornadas de la liguilla con la victoria por 1-0 frente al filial gallego gracias al gol de Cuyami a pase de Puntas en el minuto 72.

Entonces apareció el equipo donde más años estuvo, el Sevilla, equipo que había bajado a 2ª División, y con el que se proclamó campeón de la liga de plata y subió a Primera junto a Betis y Tenerife, esa temporada hizo debutar a Reyes, Gallardo y Antoñito, demostrando su fama de entrenador con buen ojo en las categorías inferiores.
4 temporadas estuvo Joaquín en Primera con el conjunto sevillano, rozando la clasificación para la UEFA en su primera temporada al quedarse a un punto del Alavés, equipo que la temporada anterior había sido subcampeón del 2º torneo continental. Dos temporadas después hizo debutar a más jugadores importantes como Sergio Ramos, Jesús Navas y Antonio Puerta, año en el que terminó 6º logrando la clasificación para la UEFA.
En la campaña siguiente repitió 6º puesto y clasificación para la UEFA (que ganarían con Juande Ramos al mando y gran parte del bloque de jugadores de Caparros), competición en la que esa temporada llegó hasta los Octavos de final donde fue eliminado por el Parma de Gilardino.


El técnico dejó el banquillo al perder la presidente Fernando García Macua en las elecciones y Marcelo Bielsa pasó a ser el nuevo míster del conjunto de San Mamés (siendo subcampeón de la Europa League). Volvió a la liga española ya comenzada la temporada siguiente, fichando por el Mallorca al que cogió en la zona baja y con el que logró la salvación a falta de 4 jornadas desde que tomó las riendas de los de la isla el utrerano sumó puntos de conjunto de Champions para conseguir el objetivo por el cual fue fichado. En la temporada siguiente fue destituido, tras un gran comienzo de liga el conjunto rojillo comenzó a perder partidos, su sustituto Manzano no logró revertir la situación.

Quizás los equipos de Caparros no sean los que mejor jueguen, pero el gran mérito del utrerano es que ha dejado su seña de "equipo" dónde ha estado, otros entrenadores han recogido los frutos del buen trabajo del sevillano con la confección de los bloques en los años posteriores. Sin duda un técnico que define lo que es trabajar para conseguir un “equipo”, sus resultados están ahí y su buen ojo para confiar en las canteras también, jugadores importantes para el pasado, presente y futuro de la selección como Sergio Ramos, Jesús Navas, Fernando Llorente, Óscar de Marcos, Iker Muniaín, Antonio Puerta...comenzaron a destacar con el utrerano como entrenador y esperemos que siga descubriendo con su buen ojo jugadores válidos con la valentía de hacerles dar sus primeros pasos en la máxima categoría nacional.